Covid-19 Covid-19 kitajski super virus

Uporabnik johan_blond je napisal:

Glede slavne "izolacije virusa".
Ameriški center za nalezljive bolezni (CDC) ga je izoliral, sekvencioniral, ga goji v ustreznih celičnih linijah.
Vsakdo, ki je usposobljen za delo z nalezljivimi virusi, lahko brezplačno dobi vzorec za nadaljne raziskave iz repozitorija.
Kaj vas skeptike tukaj moti oziroma, kaj bi še želeli.


Timeline:

On January 20, 2020, CDC received a clinical specimen collected from the first reported U.S. patient infected with SARS-CoV-2. CDC immediately placed the specimen into cell culture to grow a sufficient amount of virus for study.
On February 2, 2020, CDC generated enough SARS-CoV-2 grown in cell culture to distribute to medical and scientific researchers.
On February 4, 2020, CDC shipped SARS-CoV-2 to the BEI Resources Repository.
An article discussing the isolation and characterization of this virus specimen is available in Emerging Infectious Diseases.

Labs

COVID-19 resources and guidelines for labs and laboratory workers.

www.cdc.gov

Harcourt J, Tamin A, Lu X, Kamili S, Sakthivel SK, Murray J, et al. Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 from Patient with Coronavirus Disease, United States. Emerg Infect Dis. 2020;26(6):1266-1273. https://doi.org/10.3201/eid2606.200516

Klikni za razširitev

Fino da si se potrudil, hvala.

Zdaj, za druge ne bom govoril, mene pa moti naslednje (vzeto iz članka iz povezave na strani, ki si jo lepil - na tvoji povezavi ni govora o načinu izolacije)
torej v temle prispevku https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/26/6/20-0516_article

Methods​

Specimen Collection​

Virus isolation from patient samples was deemed not to be human subjects research by the National Center for Immunizations and Respiratory Diseases, Centers for Disease Control and Prevention (CDC) (research determination no. 0900f3eb81ab4b6e). Clinical specimens from a case-patient who had acquired COVID-19 during travel to China and who was identified in Washington, USA, were collected as described (1). Nasopharyngeal (NP) and oropharyngeal (OP) swab specimens were collected on day 3 postsymptom onset, placed in 2–3 mL of viral transport medium, used for molecular diagnosis, and frozen. Confirmed PCR-positive specimens were aliquoted and refrozen until virus isolation was initiated.

Klikni za razširitev

Poudaril in italiksiral (dobra beseda, moram patentirat) sem jaz. Če prav razumem, so PCR naredili preden je bil virus izoliran? Prav tako so določili da ni človeškega izvora (prvi stavek) pred izolacijo? Lahko da narobe berem. Ampak potem je tole napisano hudo narobe....

Cell Culture, Limiting Dilution, and Virus Isolation​

We used Vero CCL-81 cells for isolation and initial passage. We cultured Vero E6, Vero CCL-81, HUH 7.0, 293T, A549, and EFKB3 cells in Dulbecco minimal essential medium (DMEM) supplemented with heat-inactivated fetal bovine serum (5% or 10%) and antibiotics/antimycotics (GIBCO, https://www.thermofisher.comExternal Link). We used both NP and OP swab specimens for virus isolation. For isolation, limiting dilution, and passage 1 of the virus, we pipetted 50 μL of serum-free DMEM into columns 2–12 of a 96-well tissue culture plate, then pipetted 100 μL of clinical specimens into column 1 and serially diluted 2-fold across the plate. We then trypsinized and resuspended Vero cells in DMEM containing 10% fetal bovine serum, 2× penicillin/streptomycin, 2× antibiotics/antimycotics, and 2× amphotericin B at a concentration of 2.5 × 105 cells/mL. We added 100 μL of cell suspension directly to the clinical specimen dilutions and mixed gently by pipetting. We then grew the inoculated cultures in a humidified 37°C incubator in an atmosphere of 5% CO2 and observed for cytopathic effects (CPEs) daily. We used standard plaque assays for SARS-CoV-2, which were based on SARS-CoV and Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV) protocols (9,10).

Klikni za razširitev

(zgornji citat se nadaljuje takoj za prejšnjim)
Prva dva stavka sta spet poudarjena z moje strani. Ker sta bistvo.
Zdaj, ko sem jaz prvič slišal (ne vem za druge, ne bom govoril v njihovem imenu, čeprav sem zasledil, da se je pričakovalo podobno), da je bil virus izoliran sem pričakoval nekaj v naslednjem smislu: vzame se smrkelj, pljunek ali kaj podobno ogabnega, se ga na nek način očisti navlake (ne vem, recmo centrifuga ...) in fukne pod elektronski miskroskop, da se pogleda kaj tam plava (no, je plavalo, ker pod tem mikroskopom se ne da gledat nič migajočega) in se določi v smislu tole buckico poznamo, tisto palčko tut, zvezdica je tudi nekam znana, tale krogec je pa nekam čuden pa še veliko jih je, najbrž je to to.

Zgodi se pa opisano v prvih dveh stavkih. Vzorec se vrže v kopel z vero celicami (celice opičjih ledvic, žive z vsem kar je tam notri), doda goveji serum, kar je nova zaloga celic in genskega mateiala in vse to se zalije zmešanico hranil, kjer je hranil ravno dovolj, da celice še nekaj časa životarijo (po domače, strada se jih dokler ne poginejo). Za nameček dodajo mešanici še antibiotike in antimikotike (ki niso ravno blagodejni za stradajoče in umirajoče celie ledvic). In iz te mešanice razpadajočih celic in genskega material potem pade ven ... kaj že? Nekaj kar je podobno virusom, no al pa so virusi čudno podobni temu. Ker (menda, nimam še 100% potrditve; jebat ga ves čas pa tudi ne morem gledat te stvari) podobna mešanica delcev pade ven tudi, če se v to župco ne da nobenega vzorca...

To je več ali manj enak postopek že od leta mislim da 1954 (patent), kjer mojster opisuje različne metode za "izolacijo" in samo ta je dala približen rezultat. Za dokončen rezultat so morali vzorec še dodatno "fiksirati" (karkoli že to pomeni...) da so sploh lahko videli kaj določenega oz. drugačnega od ostalih preizkušenih metod. (klinc, sem bil prepričan da imam shranjen patent; očitno sem ga tako dobro spravil, da ga še sam ne najdem)
Podobno kot sem zasledil kakšen teden nazaj v eni študiji, ki je bila lepljena sem, kjer so gledali vzorec (pridelan na zgornji način se mi zdi) kjer so videli kroglice ne pa spajkov. In so v župco dodali še tripsin (encim, ki razgrajuje beljakovine), pol pa so se spajki čudežno prikazali. Ne, nisem shranil te študije, je pa nekje na straneh alterja.

Se ti še zdi čudno zakaj imam vprašanja? Tak postopek sem videl kadarkoli sem še kopat po izvoru "izolata". In kolikor sem videl do sedaj, je bil tak postopek uporabljen za vse viruse. Žal mi je, iščem naprej....

Najbolj hecno je, da iz zgoraj opisane župce razni ihani znajo potegnit ven virus, direktno iz originalnega vzorca vzetega s človeka pa očitno ne. Premalo virusa v vzorcu? Ammm ... ga je pa dovolj, da se bojimo izdihanih kapljic, ker nas bodo pogubile, če ne bo ... mask?! Najbrž sem jaz čuden, ker ne znam zvezat tele zadeve ....

Confirmed PCR-positive specimens were aliquoted and refrozen until virus isolation was initiated.

Smrkelj iz grla so zamrznili, shranili, potem pa odmrznili in se spravili na delo.
Glede na to da zamrznejo spermo in potem naprej delajo otroke, ko jo odmrznejo, da zamrznejo popkovnično kri in jo potem uporabijo za zdravljenje takšno zamrzovanje ni nič neobičajnega.

Naprej je pa ena huda mineštra. Nekaj je izolacija virusa, nekaj pa je gojenje virusa. Vero celice, antibiotiki in antimikotiki, to je vse standardni postopek za gojenje virusa (se pravi Sars-Cov-2 gojiš v laboratoriju).

Glej, moral se boš sprijaznit, da ene stvari enostavno presegajo tvoje trenutne zmožnosti.
Jaz imam tudi veselje kaj sam pošravfat in popravit, pa sem se kljub youtube tutorialov odločil, da fotoaparat dam na servis, pa EGR ventila se tudi nisem lotil sam menjavat.
Enostavno sem zaupal mehaniku, da bo znal dobro zamenjat.
In če ti par ljudi reče, da v tem protokolu za izolacijo virusa in v tem protokolu za gojenje virusa na vidijo kakšnih problemov bo to očitno to.
Še en namig, če nekdo reče v rem protokolu je narobe sledeče, .... je to en novo diskusije.
Če pa kdo razlaga, jaz pa tega ne razumem, pa tega ne razumem, pa je očitno problem v razumevanju osebe, na pa na sami stvari.

Uporabnik johan_blond je napisal:

Confirmed PCR-positive specimens were aliquoted and refrozen until virus isolation was initiated.

Smrkelj iz grla so zamrznili, shranili, potem pa odmrznili in se spravili na delo.
Glede na to da zamrznejo spermo in potem naprej delajo otroke, ko jo odmrznejo, da zamrznejo popkovnično kri in jo potem uporabijo za zdravljenje takšno zamrzovanje ni nič neobičajnega.

Naprej je pa ena huda mineštra. Nekaj je izolacija virusa, nekaj pa je gojenje virusa. Vero celice, antibiotiki in antimikotiki, to je vse standardni postopek za gojenje virusa (se pravi Sars-Cov-2 gojiš v laboratoriju).

Glej, moral se boš sprijaznit, da ene stvari enostavno presegajo tvoje trenutne zmožnosti.
Jaz imam tudi veselje kaj sam pošravfat in popravit, pa sem se kljub youtube tutorialov odločil, da fotoaparat dam na servis, pa EGR ventila se tudi nisem lotil sam menjavat.
Enostavno sem zaupal mehaniku, da bo znal dobro zamenjat.
In če ti par ljudi reče, da v tem protokolu za izolacijo virusa in v tem protokolu za gojenje virusa na vidijo kakšnih problemov bo to očitno to.
Še en namig, če nekdo reče v rem protokolu je narobe sledeče, .... je to en novo diskusije.
Če pa kdo razlaga, jaz pa tega ne razumem, pa tega ne razumem, pa je očitno problem v razumevanju osebe, na pa na sami stvari.

Klikni za razširitev

Hmmm... malo prikrito (no, niti ne tako prikrito) podcenjevanje, čeprav ti dam v veliki meri prav. Nisem v posvečenem krogu virologov. Očitno tudi ti ne. Ti pač zaupaš ljudem, ki pravijo, da je ta postopek v redu. Jaz pa ne najbolj pa mi dol visi za njihove kompetence.

In nisem edini. Ljudje z veliko bolj zvenečimi nazivi pred priimki pravijo, da s tem postopkom ni vse v redu. Zdrava pamet tudi.

Ti pa tudi nisi nič povedal konkretnega glede na dilem, ki sem jih izpostavil (zamrzovanje vzorca nisem niti omenjal, ne vem zakaj toliko besed namenjenih temu nepomemneu detajlu? razen če je to šolanje nekoga mene, ker me pač določene zadeve presegajo...). Se motim, če iz zgoraj linkanega prispeka na strani CDC ni zaslediti, da so izolirali virus direktno iz vzorca pacienta? Mislim da ne. Prosim pokaži če se motim, bom hvaležen do konca življenja. Je pa povedano, da so vzorec vzeli, takoj opredelili da je nečloveškega izvora, ga PCR analizirali (na podlagi česa pa?) zamrznili, potem pa namnožili na opisan način in ga potem izolirali, opredelil itd .... Ta del je pa problematičen. Če bi bil vrstni red obraten prav, tako pa ....
Še enkrat, če se motim na podlagi napisanega v prispevku prosim za usmerjanje na ustrezen del v napisanem. Ne jebem in ne provociram, res bi rad videl.
Je pa res, nisem dohtar, ne virolog, niti mehanik ne, sem samo kmet. Ki pa vseeno zna brat pa stvar ali dve zvezat. Če je špage dovolj. Tukaj je zaenkrat ne vidim.

Pa še enkrat hvala za trud (v imenu drugih za katere se trudiš)

V rusiji se ze zacenja sezona obolenj?

Od pacienta, ki je prišel iz kitajske so vzeli dva vzorčka (NP in OP).
Iz vsakega so vzeli majhen (minimalno potrebno količino vzorca za analizo) delež za PCR analizo, ostalo so zmrznili.
Ko so iz tega majhnega vzorčka potrdili s PCR, da zagotovo vsebuje virus, so te iste zamrznjene vzorčke odmrznili in se lotili izolacije virusa. To je ta aliquoted.
Zakaj so vzorček razdelili: tisti del, ki gre na PCR je neuporaben za izolacijo virusa. Zakaj so delali PCR analizo, niso pa šli direktno na izolacijo virusa. Ker se ne bo nobeden pri zdravi pameti j*bal z izolacijo virusa, če ne bo pred tem nedvoumno potrjeno da je "v tem pljunku" tudi virus. To, da je bil včeraj človek pozitiven, ne pomeni nič.
Podobno kot greš na odvzem krvi in ti napolnejo tri epruvetke. Vsaka je za svoj tip analize, ampak je še vedno ista kri.
Tako, da vsekakor velja, da so virus izolirali direktno iz vzorca pacienta (jaz sem mislil, da te je zmotilo to zmrzovanje, ampak sem kasneje videl kje je problem).

Uporabnik SamSvoj je napisal:

Hmmm... malo prikrito (no, niti ne tako prikrito) podcenjevanje, čeprav ti dam v veliki meri prav. Nisem v posvečenem krogu virologov. Očitno tudi ti ne. Ti pač zaupaš ljudem, ki pravijo, da je ta postopek v redu. Jaz pa ne najbolj pa mi dol visi za njihove kompetence.

In nisem edini. Ljudje z veliko bolj zvenečimi nazivi pred priimki pravijo, da s tem postopkom ni vse v redu. Zdrava pamet tudi.

Klikni za razširitev

Ni bilo to nobeno podcenjevanje, ampak realna ocena situacije mora biti. Če želiš iti z nekom v konfrontacijo, moraš biti realen, kje si z znanjem in razumevanjem.
To je tako kot da bi jaz, ker sem po sreči zadel s sredine igrišča, si domišljal da premagam Dončiča v ena na ena.
Se pa strinjam da ni nobene potrebe, da bi slepo zaupal v nazive. AndY1 je tudi prilimal en znanstveni članek, kako je bil Sars-Cov-2 v Italiji že dolgo pred uradno potrditvijo, pa sem tudi sam napisal, da je članek slab (in da menim, da so sklepi povsem napačni).
Samo jaz se upam to utemeljit z argumentacijo od točke do točke (in pa to nima veze ali sem iste stroke ali ne).
Če pa si na nivoju, da ti ni nič jasno in to je to, moraš pa sam sebe vprašat, kje je problem.

Uporabnik endvatri je napisal:

Kje si darjan ?
Rusija podira rekorde.
Pa vsi ste bentili ker ni mogoče dobiti ruskega cepiva...pa vsi bi se cepili z rusom.
Poglej priponko 47445

Klikni za razširitev

tudi Rusi se niso cepili

Uporabnik ferdo je napisal:

tudi Rusi se niso cepili
Poglej priponko 47450

Klikni za razširitev

Če pa se je tu gor pisalo, kako v Rusiji noben ne upa odklonit cepiva. Pa da bi tak režim mi rabili za boljšo precepljenost.

Razlog je jasen. V Angliji pada, ker je 70% cepljenih, v Izraelu raste, ker je 30% necepljenih .

Uporabnik Ytbnd je napisal:

Surprise dip in UK COVID cases baffles researchers

Daily recorded infections have more than halved since mid-July. Few researchers anticipated such a sharp decline, and they are now struggling to interpret it.

www.nature.com

Razlog je jasen. V Angliji pada, ker je 70% cepljenih, v Izraelu raste, ker je 30% necepljenih .

Klikni za razširitev

V UK so cepljeni predvsem s AZ, v Izraelu pa skoraj v celoti s Pfizerjem.


Da me ne bo kdo resno jemal, to je samo toliko, da demonstriram, da je takšne sklepe težko izvajat, ko imaš toliko različnih faktorjev.

Sem pa povsem resno že kar nekaj časa nazaj napisal da sta UK in Izrael prva dva, ki jih bom spremljal, ker bosta relevantna pokazatelja kako se dogaja s cepivi v praksi.
Rezultati zaenkrat niso enoznačni, upam da bo šlo v smeri UK.

Ali bo UK prva država brez respiratornih obolenj čez zimo?

Tudi Islandija ima visoko stopnjo cepljenih.


Vs cepljena

Švedska z AZ

"Zakaj je tako? Ker smo Vzhodna Evropa. Kakor koli vzamemo, smo vzhodna Evropa," je dejal Krek in dodal, da se kažejo leta in leta zapostavljanja vlaganja v ozaveščanje javnosti o pomenu cepljenja. "Produkt je ta, da ljudje niso navajeni cepljenja in da imajo posledično tisoč in en razlog, zakaj ne pridejo na cepljenje," je dejal in kot primere dobrih praks omenil Norveško, Islandijo, Dansko, Irsko, Portugalsko, Malto in Španijo, kjer je delež precepljenih starostnikov nad 80. letom starosti 100-odstoten.

Klikni za razširitev

Krek se ne more sprijaznit, da zivi na Balkanu. naj gre potem v sterilno Dansko, oz. kaksno drugo severno dezelo, kjer zivijo brez bolezni in so vsi pocepljeni.

in se otrok niso pocepili, pa ze spet tezijo z ucitelji.

kako kaj hospitalizacije? 4. val je ze dolgo prisoten, v bolnicah pa 1 ali dva na dan nanovo, medtem ko je vec kot sto dnevno okuzenih?

Ja po novem je zgleda problem tudi ce je 10 hospitalizacij. Samo da se sili folk v cepljenje

Uporabnik darjan je napisal:

Ja po novem je zgleda problem tudi ce je 10 hospitalizacij. Samo da se sili folk v cepljenje

Klikni za razširitev

Saj smo že ugotovili, da po novem ni problem število mrtvih, niti število hospitaliziranih, niti število okuženih, ampak zgolj število necepljenih. Dejansko imamo epidemijo necepljenih.

Do sedaj se je s PCR iskalo okužene.
Po novem se s PCT išče necepljene.

Prihaja kappa.

Uporabnik msenjur je napisal:

kako kaj hospitalizacije? 4. val je ze dolgo prisoten, v bolnicah pa 1 ali dva na dan nanovo, medtem ko je vec kot sto dnevno okuzenih?

Klikni za razširitev

Pa dobro no, a se je res potrebno tako pogosto špilati debila?


Trenutno večino okužb prispevajo mladi.
Čez 100 okužb dnevno nismo ravno dolgo časa.
Koliko logike je potrebno, da iz tega pogruntaš, zakaj še ni hospitalizacij?
4. val prisoten