Načeloma gredo na pametno kartico samo certifikati. Lahko jih dodajaš in brišeš, kopirati jih ne moreš. Microsoft ima certutil.exe program za ukazno vrstico. Te stvari so kolikor toliko standardizirane.
Kar je več, je specifično za posamezne proizvajalce. Nekateri omogočajo celo programiranje aplikacij, ki delujejo na karticah. Samo to bo delovalo samo na tistih vrstah kartice za katero je bil narejen program.