Iz aplikacije za izdajanje računov se pošiljajo XML paketi na spletni strežnik davčne uprave (preko HTTPS/SSL). V paketu so podatki o računu (zaporedna številka, znesek, način plačila, osebna številka prodajalca, ...). Strežnik vrne JIR številko, ki jo je potrebno sprintati na račun.
Podjetja morajo vse zagotoviti sama, tudi internetno povezavo. V primeru nedelovanja le-te ima podjetje dva dni časa, da jo ponovno vzpostavi, vmes račune izstavlja na posebnih oštevilčenih obrazcih (po vzpostavitvi povezave pa jih ponovno vnese).
Podjetje lahko dokaže, da nima možnosti internetne povezave, če priloži potrdila dveh ponudnikov preko telefonskega omrežja, enega preko kabelskega omrežja in vseh treh mobilnih ponudnikov (dejansko nepovezljivost je potrebno potrditi tako, da se nedelovanje preveri z USB ključki vseh ponudnikov in zapiše, kdaj je bilo testiranje opravljeno), da ne morejo zagotoviti povezljivosti.